Você pode ter mais 3 variaveis, por ex
int aprovado = 0;
int reprovado = 0;
int final = 0;
Além das variaveis que vc já vem (acrescente essas) e pra cada N_Alunos você calcula as médias (como já está fazendo) e no final printa tudo (depois do while)
Ai fica assim depois do while:
printf("Alunos aprovados %d", aprovado);
printf("Alunos reprovados %d", reprovado);
printf("Alunos na final %d", final);
Se preferir, pode trocar o while por for e verificar as medias são >= etc o valor esperado, e incrementa o aprovado dentro do if (que eu comentei) e faz isso pra cada uma das variáveis, deu pra entender?
Ficaria tipo isso (lembrando que isso está dentro de uma estrutura de repetição)
if(media >= 6) {
printf("Aluno aprovado - media %.2f", media);
aprovado++;
}
Espero ter ajudado. Boa sorte.